5 Wojskowy Szpital Kliniczny z Polikliniką w Krakowie konsekwentnie realizuje działania mające na celu podnoszenie jakości świadczonych usług, co bezpośrednio wpływa na bezpieczeństwo, komfort oraz efektywność leczenia pacjentów. Szpital realizuje misję „Podaj prawicę potrzebującemu” poprzez zapewnienie kompleksowych, bezpiecznych i skutecznych świadczeń medycznych, opartych na aktualnej wiedzy medycznej oraz nowoczesnych metodach diagnostyki i leczenia.